École Nationale Supérieure de
Techniques Avancées

Résumé

Les limitations dans l’acquisition d’images microscopiques 3D en temps réel continuent de freiner les avancées dans de nombreuses études cellulaires. Pour mieux comprendre les structures et les comportements du mouvement cellulaire, il est nécessaire de relever plusieurs défis, notamment la recréation d’environnements in vitro ressemblant `a des scénarios réels et l’acquisition d’images en temps réel de haute qualité. Ce stage de recherche vise à développer un pipeline pour segmenter et extraire des données sur les structures et les motifs de migration cellulaire à partir d’acquisitions en temps réel réalisées à l’Institut Curie. Ces ensembles de données contiennent des échafaudages protéiques imprimés en 3D à la pointe de la technologie pour permettre la migration des cellules, mais ils sont anisométriques, jusqu’à 6,25 fois plus petits sur l’axe z. Comme de nombreux processus de traitement des données sont effectués manuellement pour chaque image et que la plupart des algorithmes de segmentation 3D sont conçus pour des images isométriques, il est nécessaire de développer un pipeline pour accélérer et améliorer le traitement des données pour ces images.