École Nationale Supérieure de
Techniques Avancées

Résumé

Ce rapport traite de la réalisation d’un algorithme de segmentation d’images en 3D. Cet algorithme a pour but de segmenter des images 3D de cerveau de souris afin d’en extraire une région correspondant au cervelet, ceci afin de calculer son volume dans le but d’une étude biologique portant sur une possible corrélation chez les souris entre trisomie et volume du cervelet, sans avoir besoin de disséquer ces dernières. A l’aide d’images IRM, il est donc possible de calculer ce volume grâce à un algorithme de segmentation. Ainsi, le rapport traite de la réalisation de l’algorithme en 2D (la réalisation en 3D découlant assez naturellement de celle en 2D) grâce au langage OCaml. Le choix du langage et la méthode de réalisation de l’algorithme fait l’objet ensuite de toute une part de réflexion et d’amélioration quant à la qualité des résultats.